Lopšelis-darželis „Ąžuoliukas“ buvo įsteigtas 1975 m. ir teikė ikimokyklinio ugdymo paslaugas. Vilkaviškio rajono valdybos 1992 m. rugsėjo 1 d. potvarkiu Nr. 159, įsteigta naujo tipo įstaiga – mokykla-darželis „Ąžuoliukas“, teikianti ikimokyklinio, priešmokyklinio ir pradinio ugdymo paslaugas.

Iki  2004 m.  rugpjūčio  31  d.  įstaiga  priklausė Vilkaviškio rajono savivaldybės švietimo skyriaus buhalterijai, o nuo 2004 m. rugsėjo 1 d., siekiant didesnio finansinių išteklių naudojimo efektyvumo, mokyklai-darželiui buvo suteiktas finansinis savarankiškumas.

2004 m. gegužės 21 d. Vilkaviškio rajono savivaldybės tarybos  sprendimu Nr. B-TS-327 prie mokyklos-darželio „Ąžuoliukas“ buvo prijungtas Gudkaimio darželis-mokykla „Spindulėlis“. Mokykla-darželis tapo bazine įstaiga, turinčia skyrių ir bendrą pavadinimą – „Ąžuoliukas“.
 
Vilkaviškio rajono savivaldybės tarybos 2019 m. rugpjūčio 23 d. sprendimu Nr. B-TS-133 Vilkaviškio r. Kybartų mokyklos-darželio „Ąžuoliukas“ pavadinimas pakeistas į Vilkaviškio r. lopšelis-darželis „Ąžuoliukas“. Nuo 2019 m. rugsėjo 1 d. pradinio ugdymo programa Gudkaimio skyriuje nevykdoma.